137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1712 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328153  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0493  hypothetical protein  58.17 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1533  hypothetical protein  58.76 
 
 		 204 aa  234  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0247  protein-disulfide isomerase-like protein  44.51 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.325899 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  37.25 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0026  hypothetical protein  29.87 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727163  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1826  hypothetical protein  31.29 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  38.82 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0978  hypothetical protein  35 
 
 		 395 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000566391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0363  hypothetical protein  30.94 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  40.48 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  26.58 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  31.43 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0293  hypothetical protein  32.45 
 
 		 415 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.850228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.71 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.71 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 265 aa  52.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  26.67 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  25.52 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.18 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  40.62 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1794  thiol:disulphide interchange protein, putative  27.72 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0574942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  25.3 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  35.56 
 
 		 270 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.08 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.08 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  36.92 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  32.84 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  36.92 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 349 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  28.32 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.31 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 348 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  35.29 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  33.33 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  30.43 
 
 		 349 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  27.22 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.55 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 262 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.55 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.55 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  36.21 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  28.24 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  26.36 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  44.68 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  28.24 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  32.84 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1672  thiol:disulphide interchange protein, putative  26.62 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.86 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  32.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 339 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  32.86 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0050  hypothetical protein  30.43 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>