114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0247 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0247  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.325899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1712  hypothetical protein  40.91 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328153  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0493  hypothetical protein  39.09 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1533  hypothetical protein  43.18 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  28.36 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  31.58 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.36 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  45.31 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  22.99 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  30.26 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  29.53 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0050  hypothetical protein  39.06 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1794  thiol:disulphide interchange protein, putative  34.52 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0574942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  27.12 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 260 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.09 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  26.42 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  33.63 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  25.83 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  25.67 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 263 aa  49.3  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  23.84 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  23.84 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  33.63 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1606  thiol:disulphide interchange protein, putative  40.98 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  25.83 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  26.44 
 
 		 284 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0523  thiol:disulphide interchange protein, putative  34.31 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.44397  normal  0.0239072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  37.7 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0363  hypothetical protein  29.67 
 
 		 409 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  25.81 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  27.55 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.33 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1958  thiol:disulphide interchange protein, putative  25.83 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1826  hypothetical protein  30.56 
 
 		 423 aa  46.6  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  23.4 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  23.63 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  41.51 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  25.24 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  25.31 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  25.31 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  22.02 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  25 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  23.44 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 273 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  23.44 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  45.1  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727163  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  42.86 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  23.3 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  42.65 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0978  hypothetical protein  30.27 
 
 		 395 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000566391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  25.84 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0293  hypothetical protein  39.18 
 
 		 415 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.850228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1672  thiol:disulphide interchange protein, putative  32.86 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  25.29 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  23.3 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  25.62 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>