60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1672 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1672  thiol:disulphide interchange protein, putative  100 
 
 		 166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0523  thiol:disulphide interchange protein, putative  71.69 
 
 		 182 aa  263  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.44397  normal  0.0239072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1606  thiol:disulphide interchange protein, putative  66.87 
 
 		 182 aa  248  3e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1794  thiol:disulphide interchange protein, putative  65.06 
 
 		 166 aa  243  8e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0574942 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1958  thiol:disulphide interchange protein, putative  32.21 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0026  hypothetical protein  25.32 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727163  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0978  hypothetical protein  43.06 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000566391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0293  hypothetical protein  41.54 
 
 		 415 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.850228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1826  hypothetical protein  41.54 
 
 		 423 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0363  hypothetical protein  43.24 
 
 		 409 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  28.97 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  28 
 
 		 248 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  28 
 
 		 248 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.26 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.26 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.26 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.26 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.26 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.71 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  28.95 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.71 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.4 
 
 		 294 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  28.18 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.71 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  26.17 
 
 		 250 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  28.93 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1533  hypothetical protein  34.72 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  27.97 
 
 		 284 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3584  hypothetical protein  31.37 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.35 
 
 		 245 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.29 
 
 		 237 aa  44.3  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1712  hypothetical protein  26.62 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328153  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.3 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0247  protein-disulfide isomerase-like protein  32.86 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.325899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  27.56 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  30.83 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  25.15 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.98 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.09 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.9 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0493  hypothetical protein  28.92 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  25.3 
 
 		 236 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.3 
 
 		 236 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.3 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.3 
 
 		 236 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 		 241 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  23.49 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  25.3 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  24.82 
 
 		 241 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.3 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  25.3 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.54 
 
 		 262 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  21.19 
 
 		 269 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.95 
 
 		 238 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  25.37 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.7 
 
 		 236 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.2 
 
 		 261 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.22718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>