183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0894 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  80 
 
 		 242 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  76.03 
 
 		 241 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  75.31 
 
 		 241 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  75.31 
 
 		 241 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  75.31 
 
 		 241 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  75.31 
 
 		 241 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  78.28 
 
 		 241 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  71.9 
 
 		 241 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  72.43 
 
 		 241 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  72.43 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  72.43 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  68.72 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  72.02 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  64.2 
 
 		 242 aa  345  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.29 
 
 		 242 aa  335  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.71 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.07 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.56 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.11 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  44.68 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.68 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.28 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.68 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  44.68 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  44.68 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.07 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.35 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.68 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.68 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.26 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.65 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.95 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.2 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.2 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.2 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.95 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.95 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.95 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.95 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.76 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  47.14 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.13 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.2 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  42.97 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.61 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  43.78 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.49 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  44.64 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.3 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.88 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  43.93 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.88 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  40.59 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.98 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  36.59 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  41.42 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.91 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  42.74 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  38.79 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.85 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  44.67 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.09 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  46.15 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  42.42 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  42.19 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.09 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  37.3 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.03 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.44 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.92 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  36.73 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  37.07 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  39.18 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  34.46 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.95 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  44.09 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  37.34 
 
 		 179 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  37.04 
 
 		 178 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  33.16 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  30.81 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.52 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  28.33 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  31.48 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  29.86 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  32.14 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  32.14 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  27.92 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  31.86 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  31.94 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  35.04 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  30.63 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  25.32 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.06 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.64 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  27.73 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.73 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  31.08 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>