154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1944 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  43.2 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  42.76 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.46 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  39.85 
 
 		 277 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.23 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40 
 
 		 247 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.93 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.23 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.88 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.88 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  39.06 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  37.09 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.23 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  37.69 
 
 		 246 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.46 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  42.4 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.37 
 
 		 245 aa  97.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  39.04 
 
 		 265 aa  97.8  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  37.69 
 
 		 243 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  36.81 
 
 		 262 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  35.07 
 
 		 285 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  36.81 
 
 		 262 aa  95.1  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.6 
 
 		 245 aa  94.7  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  37.1 
 
 		 285 aa  94.7  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.51 
 
 		 264 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  36.69 
 
 		 258 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.7 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.84 
 
 		 241 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  34.27 
 
 		 236 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  34.27 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  34.27 
 
 		 236 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.27 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.27 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.27 
 
 		 236 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.27 
 
 		 236 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.57 
 
 		 236 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  33.85 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.5 
 
 		 241 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.23 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.04 
 
 		 245 aa  88.6  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.59 
 
 		 251 aa  88.2  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  35.88 
 
 		 244 aa  87.8  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.39 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.25 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.39 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.77 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  36.51 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.39 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.3 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.65 
 
 		 242 aa  85.9  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 		 261 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 		 241 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.36 
 
 		 241 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.85 
 
 		 237 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  32.82 
 
 		 241 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.14 
 
 		 264 aa  84.7  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.61 
 
 		 238 aa  84.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.54 
 
 		 242 aa  84.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.2 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  35.29 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.59 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  36.8 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.59 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.59 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.59 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.51 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.31 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.91 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.37 
 
 		 262 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  33.58 
 
 		 272 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.77 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.91 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.1 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  31.82 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  32.86 
 
 		 298 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.69 
 
 		 255 aa  62  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  29.84 
 
 		 371 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  29.68 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  29.68 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  30 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  27.34 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.57 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  29.46 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  29.46 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  29.46 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  28.68 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.7 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  32.35 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  29.09 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  29.46 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  31.25 
 
 		 272 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.78 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  29.46 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>