155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1639 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  54.17 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  43.37 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  45.71 
 
 		 245 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  38.46 
 
 		 245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  46.77 
 
 		 237 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.29 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  36.94 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  38.19 
 
 		 254 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  40.91 
 
 		 265 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  37.5 
 
 		 263 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.34 
 
 		 245 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  37.23 
 
 		 262 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.58 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.58 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  37.23 
 
 		 262 aa  104  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.94 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.94 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.79 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  33.57 
 
 		 285 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.9 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.94 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.94 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.94 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.94 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.14 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  32.12 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 		 260 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.13 
 
 		 264 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  30.38 
 
 		 236 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.48 
 
 		 238 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.48 
 
 		 238 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.38 
 
 		 236 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.38 
 
 		 236 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.67 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.82 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.25 
 
 		 247 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.56 
 
 		 247 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.83 
 
 		 237 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.83 
 
 		 237 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.83 
 
 		 237 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.83 
 
 		 237 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.38 
 
 		 236 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.83 
 
 		 237 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.75 
 
 		 236 aa  98.2  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 		 285 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.44 
 
 		 251 aa  98.2  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  29.75 
 
 		 236 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  29.75 
 
 		 236 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.75 
 
 		 236 aa  97.8  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.97 
 
 		 242 aa  97.4  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.02 
 
 		 251 aa  97.1  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.01 
 
 		 236 aa  97.1  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.59 
 
 		 238 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.86 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.86 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  34.23 
 
 		 258 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.01 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.86 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.5 
 
 		 242 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.3 
 
 		 241 aa  95.9  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.85 
 
 		 238 aa  95.5  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  31.91 
 
 		 246 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  36.09 
 
 		 232 aa  95.1  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.31 
 
 		 239 aa  94.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35 
 
 		 262 aa  94.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.62 
 
 		 246 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  30.34 
 
 		 241 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.97 
 
 		 250 aa  94.4  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  34.85 
 
 		 277 aa  94.4  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.57 
 
 		 241 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.59 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  34.42 
 
 		 272 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  32.62 
 
 		 243 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 		 242 aa  92  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.19 
 
 		 242 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.51 
 
 		 242 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  35.9 
 
 		 244 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.24 
 
 		 245 aa  84.3  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  29.37 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  30.2 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.4 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.53 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.2 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  34.94 
 
 		 361 aa  62  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  28.77 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  29.27 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  28.1 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0032  hypothetical protein  34.94 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  32.76 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.41 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  25.38 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 		 256 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  30.47 
 
 		 242 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  30.47 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  30.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  29.41 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  30.47 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  30.47 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>