50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1794 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1794  thiol:disulphide interchange protein, putative  100 
 
 		 166 aa  338  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0574942 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1672  thiol:disulphide interchange protein, putative  65.06 
 
 		 166 aa  243  8e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1606  thiol:disulphide interchange protein, putative  61.45 
 
 		 182 aa  233  7e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0523  thiol:disulphide interchange protein, putative  60.24 
 
 		 182 aa  226  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.44397  normal  0.0239072 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1958  thiol:disulphide interchange protein, putative  33.56 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0026  hypothetical protein  22.73 
 
 		 433 aa  57.4  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727163  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0247  protein-disulfide isomerase-like protein  35.71 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.325899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  30.63 
 
 		 241 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1712  hypothetical protein  27.72 
 
 		 208 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328153  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0978  hypothetical protein  41.07 
 
 		 395 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000566391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  29.51 
 
 		 248 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0293  hypothetical protein  41.07 
 
 		 415 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.850228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1826  hypothetical protein  31.91 
 
 		 423 aa  47.8  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0363  hypothetical protein  41.07 
 
 		 409 aa  47.4  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  29.75 
 
 		 272 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.8 
 
 		 294 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  27.1 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1533  hypothetical protein  31.71 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  23.53 
 
 		 242 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  26.32 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0493  hypothetical protein  26.47 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  27.34 
 
 		 253 aa  44.3  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 		 179 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  26.19 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  27.19 
 
 		 262 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  25.62 
 
 		 248 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  25.62 
 
 		 248 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  28.17 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  30.25 
 
 		 239 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  29.17 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  22.5 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.07 
 
 		 245 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  27.61 
 
 		 246 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  22.03 
 
 		 269 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  26.79 
 
 		 260 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  27.86 
 
 		 242 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  25.61 
 
 		 242 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  27.19 
 
 		 281 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  27.05 
 
 		 238 aa  41.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  25.45 
 
 		 285 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.87 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.8 
 
 		 260 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  26.99 
 
 		 282 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  25.14 
 
 		 254 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  27.34 
 
 		 242 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  27.34 
 
 		 242 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 		 242 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  27.34 
 
 		 242 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.77 
 
 		 254 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>