174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0346 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  100 
 
 		 281 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  54.39 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  48.23 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  41.35 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  40.51 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  40.51 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.46 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  44.03 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  39.31 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  39.31 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  39.31 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  39.31 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  41.13 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  38.7 
 
 		 242 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  38.93 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  38.93 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  41.26 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  38.91 
 
 		 242 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.79 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  39.92 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.79 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.72 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.72 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.72 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.72 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.72 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  40.95 
 
 		 236 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.95 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  39.62 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  39.9 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  39.62 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  39.18 
 
 		 241 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  38.05 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  41.05 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.46 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  37.07 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  37.5 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  35.23 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  36.59 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  35.55 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.59 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  38.17 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  37.07 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  36.56 
 
 		 245 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  38.31 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.91 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  35.16 
 
 		 239 aa  148  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  34.45 
 
 		 246 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  32.91 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  31.46 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.33 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  28.57 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  28.93 
 
 		 250 aa  96.3  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  26.55 
 
 		 253 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  24.69 
 
 		 254 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  27.38 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  30.33 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  28.07 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  31.9 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  29.78 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.02 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.34 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.7 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.23 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  30.73 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 		 242 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.63 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  28.75 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.63 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.63 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  27.4 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  25.33 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.79 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.6 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  26.09 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.1 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.78 
 
 		 210 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  30.32 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.44 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.59 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.59 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.59 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.59 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.19 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  26 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.5 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.01 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.17 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.83 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.01 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.01 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  26.54 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  25.71 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.61 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.22 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>