202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2771 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  45.15 
 
 
237 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.19 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.71 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  37.04 
 
 
246 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  36.27 
 
 
245 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.65 
 
 
246 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.6 
 
 
253 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.56 
 
 
247 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.11 
 
 
260 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.67 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  37.74 
 
 
243 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  33.2 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.79 
 
 
242 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.39 
 
 
242 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  34.47 
 
 
244 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  39.36 
 
 
277 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.04 
 
 
241 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.73 
 
 
245 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.85 
 
 
264 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  35.9 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.32 
 
 
241 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.32 
 
 
241 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.32 
 
 
241 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.32 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.76 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.76 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.8 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  35.56 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  33.88 
 
 
262 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.62 
 
 
238 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  37.64 
 
 
285 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  35.47 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.07 
 
 
238 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.03 
 
 
210 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  36.14 
 
 
262 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.44 
 
 
242 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.21 
 
 
241 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.07 
 
 
238 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.07 
 
 
238 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.42 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  38.97 
 
 
236 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.97 
 
 
236 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.97 
 
 
236 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  38.97 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.36 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.49 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.97 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  38.97 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.97 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.32 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  35.1 
 
 
265 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.44 
 
 
238 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.16 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.27 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  35.61 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.44 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.76 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  33.6 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.74 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.5 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.5 
 
 
237 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.5 
 
 
237 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.5 
 
 
237 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.5 
 
 
237 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40 
 
 
237 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 
240 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.34 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.03 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  29.39 
 
 
237 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.19 
 
 
242 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  33.67 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  29.66 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  30.25 
 
 
248 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  32.88 
 
 
248 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  32.88 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  30.8 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  33 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  28.91 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.24 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  31.46 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  38.78 
 
 
179 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.86 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  27.88 
 
 
252 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.98 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.52 
 
 
264 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.13 
 
 
272 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.92 
 
 
241 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.64 
 
 
236 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  29.22 
 
 
242 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  27.5 
 
 
236 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  28.81 
 
 
242 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.14 
 
 
246 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.5 
 
 
236 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.95 
 
 
241 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  28.81 
 
 
242 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  28.81 
 
 
242 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  28.81 
 
 
242 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  29.22 
 
 
242 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  32.66 
 
 
272 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>