177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3299 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  81.17 
 
 		 238 aa  410  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  81.82 
 
 		 238 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  80.91 
 
 		 238 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  71.55 
 
 		 238 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.32 
 
 		 238 aa  362  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.32 
 
 		 238 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  74.32 
 
 		 238 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  67.23 
 
 		 237 aa  341  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  67.23 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  67.23 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  67.23 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  67.23 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  65.52 
 
 		 236 aa  334  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.52 
 
 		 236 aa  334  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.52 
 
 		 236 aa  334  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  65.52 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.52 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  65.52 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.09 
 
 		 236 aa  332  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.09 
 
 		 236 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.95 
 
 		 236 aa  332  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  65.27 
 
 		 237 aa  332  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  47.01 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.86 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.88 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.88 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  47.88 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  51.18 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  51.18 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.71 
 
 		 241 aa  214  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.71 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.26 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.76 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.83 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  48.23 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.85 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.73 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.67 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.98 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.19 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.96 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.35 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  42.86 
 
 		 258 aa  177  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00957  protein-disulfide isomeras  43.78 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.14 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004440  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.32 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.44 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  43.38 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.78 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  40.09 
 
 		 263 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.78 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.78 
 
 		 247 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.67 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  40 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  40 
 
 		 262 aa  161  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  36.7 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.17 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.75 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  40.5 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  40 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  41.86 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  41.78 
 
 		 243 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  35.74 
 
 		 244 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.2 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.61 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.6 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  32.51 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  36.77 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  37.44 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.89 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  38.55 
 
 		 277 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  39.76 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0280  putative thiol:disulfide interchange protein  33.79 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.413391  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  35.78 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.17 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2486  protein-disulfide isomerase-like protein  35.53 
 
 		 178 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1639  protein-disulfide isomerase-like protein  34.31 
 
 		 179 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00285888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.33 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  29.31 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  29.31 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  31.56 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  32.33 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  30.56 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.68 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.33 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  30.49 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0025  hypothetical protein  36.5 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.95 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  28.45 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.39 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  28.12 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  31.25 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0037  hypothetical protein  38.35 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.87 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0032  hypothetical protein  33.76 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  32.31 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.82 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>