225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0431 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  99.59 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  95.04 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  95.45 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  94.63 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  94.63 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  94.63 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  84.71 
 
 		 242 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  83.88 
 
 		 242 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  83.88 
 
 		 242 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  83.88 
 
 		 242 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  83.88 
 
 		 242 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  83.88 
 
 		 242 aa  417  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  83.88 
 
 		 245 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  83.88 
 
 		 245 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  75 
 
 		 241 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  73.97 
 
 		 241 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  75.21 
 
 		 241 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  54.66 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  58.18 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  60.55 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  60.55 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  57.01 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  49.13 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.13 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  49.11 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  45.45 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  49.3 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  50.47 
 
 		 245 aa  234  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  44.4 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.77 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.41 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.34 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  48.11 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  46.43 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  45.61 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  45.65 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  50.5 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  47.53 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.33 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  42.37 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  46.15 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  39.74 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  39.54 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  39.91 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  40.46 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  37.44 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  36.4 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.5 
 
 		 282 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  29.12 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.47 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  36.27 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.9 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  30.17 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.09 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.47 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  30.6 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.81 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  31.3 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  31.96 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  32.42 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  33.15 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.63 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.84 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.93 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  30.41 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  32.26 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.89 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  29.53 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.54 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  29.34 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  31.19 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.67 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.67 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.34 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.42 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.32 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  27.13 
 
 		 284 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  27.86 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.03 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.05 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.05 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.05 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.05 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.75 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  28.35 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  28.46 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.74 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  27.47 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.83 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1994  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.93 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  26.18 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.35 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.79 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.2 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  26.09 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.76 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>