186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0592 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  62.72 
 
 		 235 aa  308  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  53.42 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  53.42 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  54.11 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  55.56 
 
 		 246 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  51.03 
 
 		 247 aa  254  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  53.51 
 
 		 237 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50 
 
 		 272 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  51.14 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  47.37 
 
 		 248 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  46.25 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  46.08 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  47.22 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  46.98 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  45.83 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  45 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  47.22 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  45.73 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  47.87 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  44.17 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  44.17 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  44.17 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.19 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  39.48 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  39.92 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  44.29 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  44.29 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  45.97 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  44.74 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  45.13 
 
 		 241 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  43.66 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  40.85 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.47 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.73 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  36.36 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  36.43 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.34 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  35.94 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  35.98 
 
 		 276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  33.47 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  36.79 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  33.97 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  33.66 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  32.8 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.2 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.05 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  32.27 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  32.37 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  34.55 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  34.26 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.63 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  29.92 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.26 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.72 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.78 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.78 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.78 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  34.08 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.78 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.8 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.16 
 
 		 210 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.23 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.22 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.62 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.06 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.84 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.48 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.42 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.95 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  28.97 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.18 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.8 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.33 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.17 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  29.44 
 
 		 263 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.84 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  31.93 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.48 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  32.62 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.59 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.96 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  33.17 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  29 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  29 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.77 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.92 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  29.63 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>