194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3367 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  100 
 
 
245 aa  500  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  78.63 
 
 
237 aa  387  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  72.53 
 
 
247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  68.42 
 
 
236 aa  333  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  70.18 
 
 
236 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  68.37 
 
 
246 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  63.39 
 
 
272 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  64.22 
 
 
246 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  61.86 
 
 
240 aa  292  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  56.83 
 
 
235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  56.28 
 
 
246 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  50.47 
 
 
242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  50.47 
 
 
242 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  51.6 
 
 
233 aa  234  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  50 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  50 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
245 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.53 
 
 
245 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  45.27 
 
 
242 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  49.53 
 
 
242 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  48 
 
 
237 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  49.06 
 
 
242 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  49.06 
 
 
242 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  49.06 
 
 
242 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  48.46 
 
 
238 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  47.64 
 
 
241 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  46.7 
 
 
241 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  46.67 
 
 
241 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  44.34 
 
 
249 aa  205  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  41.99 
 
 
252 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  46.35 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  42.74 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  45.58 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  45.58 
 
 
248 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  44.96 
 
 
239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.2 
 
 
236 aa  188  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  40.83 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  36.13 
 
 
254 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  36.74 
 
 
282 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  36.56 
 
 
281 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  36.44 
 
 
276 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  33.72 
 
 
272 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  33.46 
 
 
272 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  38.69 
 
 
238 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  37.82 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  32.16 
 
 
256 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  32.5 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  28.69 
 
 
246 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.68 
 
 
241 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.17 
 
 
246 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.45 
 
 
242 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  27.95 
 
 
241 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  33.96 
 
 
255 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  28.77 
 
 
243 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  27.04 
 
 
244 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.67 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.35 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.61 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.6 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.44 
 
 
240 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.7 
 
 
260 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.27 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.15 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.15 
 
 
247 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.69 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.69 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  32.02 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.05 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.18 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  28.27 
 
 
284 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  30.08 
 
 
242 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.74 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.81 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  28.96 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.22 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  28.25 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  29.82 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.82 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.59 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.82 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.82 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.82 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 
237 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 
237 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 
237 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 
237 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.51 
 
 
242 aa  89  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  29.36 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.82 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.36 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  29.36 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  28.23 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.96 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.96 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>