221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0948 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
245 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
245 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  98.35 
 
 
242 aa  486  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  85.12 
 
 
242 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  84.3 
 
 
242 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  83.88 
 
 
242 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  83.47 
 
 
242 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  84.3 
 
 
242 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  84.3 
 
 
242 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  84.3 
 
 
242 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  75.21 
 
 
241 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  74.69 
 
 
241 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  73.97 
 
 
241 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  55.06 
 
 
248 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  56.9 
 
 
252 aa  285  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  58.18 
 
 
249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  59.17 
 
 
248 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  58.72 
 
 
248 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  49.12 
 
 
236 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.12 
 
 
236 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  50.48 
 
 
246 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  48.66 
 
 
233 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  50.24 
 
 
240 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  46.72 
 
 
272 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.19 
 
 
247 aa  234  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  49.53 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  48.33 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  45.11 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  43.8 
 
 
238 aa  231  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  46.23 
 
 
237 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  44.35 
 
 
242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  45.41 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  47.66 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  45.29 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
237 aa  208  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  41.95 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  45.96 
 
 
236 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  45.64 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  40.61 
 
 
238 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  39.62 
 
 
272 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  38.36 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  39.46 
 
 
272 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  38.97 
 
 
254 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  35.29 
 
 
276 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.85 
 
 
282 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  33.88 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.52 
 
 
241 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.05 
 
 
245 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.72 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  31.6 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.67 
 
 
242 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.67 
 
 
242 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.68 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  32.8 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  33.88 
 
 
250 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.2 
 
 
246 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  34.94 
 
 
269 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.48 
 
 
242 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  34.02 
 
 
242 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  33.2 
 
 
244 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  34.54 
 
 
242 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27 
 
 
254 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30.36 
 
 
245 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  33.62 
 
 
246 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  33.02 
 
 
243 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  31.22 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.07 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.07 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.82 
 
 
294 aa  96.3  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  29.13 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.8 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  27.04 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.53 
 
 
253 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  28.22 
 
 
284 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.65 
 
 
210 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.11 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  28.52 
 
 
298 aa  88.6  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  27.23 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  30.26 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.21 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  27.56 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  27.56 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  82  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  27.95 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.88 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.74 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.96 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.74 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.96 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.04 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  30.4 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.96 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.74 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>