194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3505 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  40.68 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  47.44 
 
 
242 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  47.44 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  47.44 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  47.44 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  47.44 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  47.01 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  47.44 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.04 
 
 
236 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
242 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
242 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
242 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
242 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
242 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
245 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  49.76 
 
 
245 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  45.29 
 
 
241 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  49.28 
 
 
242 aa  205  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  45.93 
 
 
241 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  44.39 
 
 
241 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  43.28 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  42.92 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  44.39 
 
 
240 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  41.31 
 
 
252 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  42.72 
 
 
249 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  44.23 
 
 
248 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  42.99 
 
 
248 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.56 
 
 
247 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  44.23 
 
 
248 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  43.64 
 
 
246 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  42.73 
 
 
246 aa  184  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.23 
 
 
272 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  42.27 
 
 
237 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  41.1 
 
 
242 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  39.64 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  41.92 
 
 
235 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  40.91 
 
 
245 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  40 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  33.19 
 
 
237 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  36.82 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  39.73 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  37.62 
 
 
249 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  33.76 
 
 
238 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  35.59 
 
 
281 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.21 
 
 
272 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  35.86 
 
 
282 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  34.78 
 
 
272 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  36.04 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  36.77 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.11 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  30.83 
 
 
256 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  33.48 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  33.47 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.64 
 
 
246 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.47 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  32.64 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.61 
 
 
237 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 
237 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 
237 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 
237 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.2 
 
 
237 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.54 
 
 
241 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.17 
 
 
242 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  29.05 
 
 
236 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.05 
 
 
236 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.05 
 
 
236 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  29.05 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  32.39 
 
 
250 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.05 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.05 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  29.05 
 
 
236 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.63 
 
 
236 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  32.39 
 
 
250 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  31.08 
 
 
241 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.05 
 
 
236 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.47 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.51 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  31.16 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  30.97 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.33 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.58 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.99 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.38 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  30.92 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.22 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.41 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.41 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.41 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.19 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.33 
 
 
238 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.19 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  31.79 
 
 
253 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.19 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.33 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.38 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.58 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  31.08 
 
 
284 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.21 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.21 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>