173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6799 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  44.73 
 
 
249 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  45.04 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  44.03 
 
 
281 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  35.15 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  36.4 
 
 
242 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  36.82 
 
 
242 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  36.4 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  36.4 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  36.4 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
242 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
242 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
242 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
242 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 
242 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  36.67 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  36.4 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  34.03 
 
 
241 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  34.03 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  32.77 
 
 
241 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.87 
 
 
236 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  34.98 
 
 
248 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  37.87 
 
 
236 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  36.55 
 
 
239 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.5 
 
 
272 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  34.57 
 
 
248 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  35.59 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  37.18 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  35.98 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  36.44 
 
 
245 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  33.71 
 
 
248 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  35.74 
 
 
237 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  37.34 
 
 
272 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.9 
 
 
236 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.77 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.45 
 
 
247 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  36.13 
 
 
235 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  30.9 
 
 
237 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  34.19 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.02 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  36.21 
 
 
282 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  29.71 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.48 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  29.88 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  29.63 
 
 
238 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  30.77 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  35.09 
 
 
256 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  31.62 
 
 
242 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  38.57 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.89 
 
 
242 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  32.72 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.46 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.18 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  29.37 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  30.38 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.8 
 
 
210 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.82 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  29.55 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  29.77 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.11 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  26.75 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  28.84 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.84 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  26.32 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.4 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.89 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  24.26 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.4 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  26.8 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  24.56 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  28.32 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  25.59 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.51 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  26.2 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.14 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.14 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  23.04 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.88 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  23.11 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  24.77 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.88 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  26.74 
 
 
293 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.45 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.86 
 
 
238 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.64 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.59 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.33 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  25.52 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.71 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  24.6 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.77 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.73 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  27.54 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  27.45 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>