178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2318 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  88.97 
 
 		 272 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  60 
 
 		 282 aa  318  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  38.31 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  43.87 
 
 		 249 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  39.42 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  37.74 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  39 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  38.55 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  39.54 
 
 		 242 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  39.16 
 
 		 242 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  41.38 
 
 		 281 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  38.78 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  43.26 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  38.4 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  38.4 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  38.4 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  42.59 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  39.33 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  37.5 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  38.08 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  38.6 
 
 		 241 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  35.83 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  40.09 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  35.39 
 
 		 252 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.29 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.18 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  38.46 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  35.92 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.74 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  37.08 
 
 		 233 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.75 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  37.5 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  35.83 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  35.27 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  33.72 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.28 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  34.69 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  35.37 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  33.2 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  32.5 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  34.11 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  30.43 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  30.88 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.06 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.45 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.17 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  26.4 
 
 		 246 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.71 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.21 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.79 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.43 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.68 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  25.2 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.9 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.78 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  27.51 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  24.02 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.82 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  25.6 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.21 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.21 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.21 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  27.34 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  29.25 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.6 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  29.84 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  25.2 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  27.16 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.6 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.83 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  25.84 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.8 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.8 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.8 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  27.97 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.89 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.8 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  27.64 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.6 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  26.21 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  27.06 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  28.02 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  25.74 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  25 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.73 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  27.43 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.42 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  25.54 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  28.29 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>