19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0026 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0026  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  879    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727163  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1712  hypothetical protein  29.87 
 
 
208 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328153  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1672  thiol:disulphide interchange protein, putative  25.32 
 
 
166 aa  63.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0493  hypothetical protein  30.97 
 
 
205 aa  63.2  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0523  thiol:disulphide interchange protein, putative  24.2 
 
 
182 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.44397  normal  0.0239072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1533  hypothetical protein  36.25 
 
 
204 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1794  thiol:disulphide interchange protein, putative  22.73 
 
 
166 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0574942 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1606  thiol:disulphide interchange protein, putative  26.58 
 
 
182 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  25.65 
 
 
247 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0363  hypothetical protein  35.14 
 
 
409 aa  47  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  24.83 
 
 
241 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1826  hypothetical protein  28.68 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0978  hypothetical protein  36.84 
 
 
395 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000566391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 
275 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0247  protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
217 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.325899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
237 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
237 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1958  thiol:disulphide interchange protein, putative  23.87 
 
 
182 aa  43.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>