212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0265 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 203 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  85.71 
 
 		 203 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  86.7 
 
 		 203 aa  352  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  80.3 
 
 		 203 aa  322  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  76.85 
 
 		 203 aa  315  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  78.39 
 
 		 203 aa  310  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  76.35 
 
 		 204 aa  309  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  77.84 
 
 		 203 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  77.84 
 
 		 203 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  78.38 
 
 		 202 aa  308  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  78.71 
 
 		 205 aa  308  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  79.66 
 
 		 202 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  79.21 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  79.21 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  79.21 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  79.21 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45.32 
 
 		 202 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.78 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  45.32 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  41.29 
 
 		 200 aa  167  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 250 aa  160  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.45 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  38.19 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.02 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.02 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.02 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.41 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.58 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  43.09 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 251 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.01 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.2 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.2 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.2 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.2 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  44.2 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 		 251 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  42.55 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  35.05 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.5 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.43 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.39 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  35.68 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.88 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  41.58 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.96 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.92 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.79 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  30.84 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.31 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  37.13 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.3 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.13 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.86 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  38.59 
 
 		 275 aa  104  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.49 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  33.7 
 
 		 293 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  33.98 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  31.96 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.04 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 		 213 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.51 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.12 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  33.64 
 
 		 223 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  33.64 
 
 		 223 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  33.64 
 
 		 223 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  33.64 
 
 		 223 aa  95.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  33.64 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.85 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.35 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>