181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1364 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  60.65 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  47.06 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  46.12 
 
 
220 aa  195  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  48.34 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  45.41 
 
 
216 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  45.41 
 
 
216 aa  188  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  48.36 
 
 
218 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
224 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  46.67 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  43.32 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  39.17 
 
 
214 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.58 
 
 
211 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.1 
 
 
211 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  39.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  39.33 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  39.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.78 
 
 
212 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.89 
 
 
210 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
210 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  39.23 
 
 
212 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 
215 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 
212 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.63 
 
 
214 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.45 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 
214 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  36.26 
 
 
212 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 
213 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  36.52 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  34.24 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  37.84 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.41 
 
 
216 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  34.67 
 
 
225 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  34.22 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  32.06 
 
 
206 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 
206 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  31.15 
 
 
213 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.55 
 
 
216 aa  104  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  32.78 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
271 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.55 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  30.63 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 
220 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
216 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  30.81 
 
 
293 aa  91.7  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  27.14 
 
 
207 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  30.3 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.06 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.62 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 
275 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  30.36 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.54 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.57 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.71 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.72 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.72 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.72 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.72 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.72 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.23 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.23 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.23 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.72 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.34 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.11 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>