230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0524 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
201 aa  418  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  35.11 
 
 
211 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 
218 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
210 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.61 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 
213 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
275 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.65 
 
 
214 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 
216 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
210 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  36.62 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
211 aa  92  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  32.28 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  34.06 
 
 
293 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  31.25 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 
206 aa  89  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
260 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
213 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
213 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
213 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
212 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
212 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.65 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.67 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.5 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.5 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.75 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  34.31 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  28.5 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.47 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 
218 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.28 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.88 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.81 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  25.86 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  29.38 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.29 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  29.73 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.05 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.05 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.05 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.25 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.05 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.05 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  28.98 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.53 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  29.14 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.08 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.11 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.1 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.1 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>