192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05306 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  85.43 
 
 
199 aa  341  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  61.81 
 
 
200 aa  258  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  61.31 
 
 
200 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  59.8 
 
 
200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  58.59 
 
 
200 aa  248  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  54.31 
 
 
207 aa  235  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 
205 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.86 
 
 
204 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  38.54 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  41.26 
 
 
207 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.78 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.78 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.78 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.78 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.78 
 
 
207 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  41.94 
 
 
203 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  40.44 
 
 
203 aa  147  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.76 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  41.57 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  40.54 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.58 
 
 
202 aa  145  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  41.01 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  41.01 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  41.01 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  41.01 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  39.61 
 
 
207 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  39.34 
 
 
203 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  37.5 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  40.56 
 
 
203 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.16 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.2 
 
 
207 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.2 
 
 
207 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.2 
 
 
207 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.16 
 
 
207 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.2 
 
 
207 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  40.88 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.29 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.44 
 
 
210 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.97 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  31.84 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  32.71 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  31.78 
 
 
218 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
250 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
251 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
251 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  32.71 
 
 
250 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  31.78 
 
 
251 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
250 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
250 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  31.78 
 
 
250 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.66 
 
 
248 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.03 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  34.59 
 
 
202 aa  99  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  32.66 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.7 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  33.7 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.7 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.7 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.7 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  33.7 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.7 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
206 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.04 
 
 
212 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.85 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
212 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
221 aa  89  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.7 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
212 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
212 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 
213 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  32.02 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>