194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1693 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
210 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  64.25 
 
 
210 aa  278  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  66.85 
 
 
208 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  56.72 
 
 
207 aa  238  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  55.72 
 
 
207 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  55.61 
 
 
210 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  58.73 
 
 
207 aa  237  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  53.66 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  53.66 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  57.67 
 
 
217 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  53.66 
 
 
206 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  53.66 
 
 
206 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  54.92 
 
 
207 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  54.44 
 
 
185 aa  208  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  32.7 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.68 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  34.02 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  34.02 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.28 
 
 
204 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.89 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
203 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  30.2 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  30.54 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  28.64 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.85 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
202 aa  85.9  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.43 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.64 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.17 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.38 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.43 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  27.6 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  29.75 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.67 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  27.56 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.57 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  27.47 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.5 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.27 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.28 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.37 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.02 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.27 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  25.4 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.84 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  24.23 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.67 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.98 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.59 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  26.13 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  27.75 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  26.13 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  26.13 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.12 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  26.13 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  26.13 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  27.72 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>