190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0257 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 
223 aa  457  9.999999999999999e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  53.27 
 
 
207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  53.06 
 
 
207 aa  235  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  52.76 
 
 
207 aa  234  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  49.25 
 
 
207 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  49.25 
 
 
207 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  49.25 
 
 
207 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  48.74 
 
 
207 aa  222  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  48.24 
 
 
207 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  48.24 
 
 
207 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  48.24 
 
 
207 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  48.24 
 
 
207 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  48.24 
 
 
207 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  51.31 
 
 
207 aa  221  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.23 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  46 
 
 
208 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  45.5 
 
 
208 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  35.18 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.75 
 
 
219 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.84 
 
 
202 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.03 
 
 
200 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  33.68 
 
 
200 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  31.35 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.05 
 
 
200 aa  118  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.14 
 
 
199 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  35.2 
 
 
207 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.97 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
203 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4888  hypothetical protein  34.55 
 
 
217 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
203 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
202 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.14 
 
 
202 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.94 
 
 
204 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
202 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
202 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
202 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
202 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 
203 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 
205 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  32.54 
 
 
203 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.98 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.32 
 
 
214 aa  95.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.42 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.65 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  25.38 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  25.68 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  23.5 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  27.81 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  25.64 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.48 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  27 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  27 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  27 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  25.73 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.79 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  25.99 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.16 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.67 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  25.11 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.41 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>