193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0158 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  73.08 
 
 		 211 aa  327  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  72.6 
 
 		 211 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  67.46 
 
 		 210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  67.46 
 
 		 210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  67.94 
 
 		 210 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  68.6 
 
 		 214 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  69.08 
 
 		 214 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  65.26 
 
 		 214 aa  298  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  66.67 
 
 		 211 aa  297  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  66.99 
 
 		 213 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  47.54 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  42.16 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  42.79 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.92 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  44.92 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.92 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.92 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.92 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  44.92 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.92 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.85 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  42.78 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  43.65 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.71 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  41.58 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  41.71 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.22 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  44.13 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  40.64 
 
 		 214 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  42.05 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  42.05 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  42.05 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  43.58 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  40.62 
 
 		 271 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  40.54 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  40.67 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  42.02 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  43.45 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  40.44 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  40.53 
 
 		 275 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  38.78 
 
 		 260 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  38.25 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  40.21 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  38.66 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  39.78 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  35.47 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  37.37 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  35.36 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  35.45 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  35.24 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  37.43 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  35.8 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  34.13 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  37.28 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  34.33 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  29.7 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  29.21 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.77 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.43 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 203 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 203 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.93 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  31.28 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.63 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>