195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0341 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  95.33 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  79.05 
 
 		 210 aa  357  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  78.1 
 
 		 210 aa  354  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  77.14 
 
 		 211 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  78.87 
 
 		 213 aa  346  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  74.76 
 
 		 210 aa  337  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  67.77 
 
 		 211 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  67.77 
 
 		 211 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  68.9 
 
 		 216 aa  304  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  60.56 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  45.55 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  41.15 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  42 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  42.49 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  43.32 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  43.32 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45.81 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  45.81 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45.81 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45.81 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45.81 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  45.81 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45.81 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  44.13 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  42.78 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.8 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  42.25 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  39.15 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  43.18 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  43.18 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  43.18 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.98 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  40.69 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  42.78 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  42.35 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  42.41 
 
 		 271 aa  147  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  39.13 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  42.29 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 		 224 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  36.41 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  37.56 
 
 		 206 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  36.81 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  36.51 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  34.58 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  35.36 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  37.7 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  36.46 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  36.02 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  35.64 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  36.07 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  30.94 
 
 		 293 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 		 233 aa  117  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  31.61 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  32.07 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  31.61 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  34.69 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.36 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.37 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.64 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.64 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.64 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.64 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.64 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  31.89 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.78 
 
 		 207 aa  89  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 203 aa  88.2  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  33.89 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.89 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>