176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0285 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  100 
 
 
218 aa  454  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  91.74 
 
 
218 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  92.2 
 
 
218 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  63.3 
 
 
211 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  60.73 
 
 
212 aa  254  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  59.56 
 
 
225 aa  252  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  51.46 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  51.46 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  50.97 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  51.46 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  51.46 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  51.46 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  51.46 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  51.46 
 
 
212 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  50.97 
 
 
213 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  52.04 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  51.53 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  51.53 
 
 
212 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  51.12 
 
 
212 aa  208  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  50.26 
 
 
212 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  50.26 
 
 
212 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  50.26 
 
 
212 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  49.09 
 
 
212 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  45.75 
 
 
215 aa  201  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  48.18 
 
 
212 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  46.08 
 
 
215 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  41.4 
 
 
210 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  42.36 
 
 
224 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  41.4 
 
 
210 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  41.28 
 
 
210 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  41.43 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.31 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.73 
 
 
214 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.35 
 
 
211 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  41.1 
 
 
211 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 
215 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  45.35 
 
 
221 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  39.61 
 
 
220 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  39.72 
 
 
220 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  42.31 
 
 
216 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  41.76 
 
 
218 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 
216 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 
216 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  41.86 
 
 
215 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 
210 aa  148  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  38.95 
 
 
216 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.1 
 
 
216 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  37.73 
 
 
223 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.75 
 
 
216 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  40.11 
 
 
213 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 
212 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 
214 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.41 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  35.94 
 
 
206 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 
206 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 
213 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  38.76 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  37.63 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  36.89 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 
208 aa  117  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
214 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  34.47 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  30.7 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  36.84 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.17 
 
 
213 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 
218 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 
275 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  39.76 
 
 
271 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 
210 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 
260 aa  98.6  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  32.95 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  30.41 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
215 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  29.17 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  29.17 
 
 
204 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.33 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.7 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.1 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  33.56 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.6 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.44 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  29 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>