177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0471 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
212 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  96.23 
 
 
212 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  83.96 
 
 
212 aa  362  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  66.98 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  66.98 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  66.98 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  66.98 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  66.98 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  66.98 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  66.98 
 
 
212 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  65.66 
 
 
213 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  66.51 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  65.46 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  66.49 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  66.04 
 
 
212 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  65.76 
 
 
212 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  65.76 
 
 
212 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  65.76 
 
 
212 aa  267  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  56.02 
 
 
211 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  59.46 
 
 
212 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  51.57 
 
 
218 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
218 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  49.09 
 
 
218 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  44.66 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  46.34 
 
 
214 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  44.71 
 
 
215 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  43.59 
 
 
224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  43.3 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 
221 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  40.78 
 
 
220 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 
216 aa  167  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 
216 aa  167  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  42.54 
 
 
218 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  42.36 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.07 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.03 
 
 
216 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  39.42 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 
223 aa  154  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 
215 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 
211 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.35 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  41.4 
 
 
215 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40 
 
 
216 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  42.42 
 
 
218 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.62 
 
 
211 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
210 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  38.46 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
210 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.59 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  35.61 
 
 
214 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  37.25 
 
 
213 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 
206 aa  134  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  34.43 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  39.3 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  34.98 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  36.22 
 
 
216 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.45 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  32.55 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
215 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
271 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 
275 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 
233 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 
210 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
216 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 
207 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
211 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.92 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  32.09 
 
 
293 aa  98.2  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  31.31 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  28.43 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  30.46 
 
 
260 aa  95.5  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.1 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.14 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  29.33 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  26.78 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  31.13 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.71 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.63 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.77 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  28.89 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>