200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0050 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 207 aa  433  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.13 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.62 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  37.22 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.6 
 
 		 214 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.39 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.58 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  37.3 
 
 		 213 aa  130  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  34.71 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  30.88 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  36.16 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.67 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.14 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  35.59 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 218 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  33.15 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  33.15 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  33.68 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  30.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  30.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.86 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  32.41 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  31.64 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  31.52 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  29.7 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  30.29 
 
 		 260 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  27.37 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  30.3 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  29.83 
 
 		 293 aa  92  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  34.78 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  32.72 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  32.3 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.72 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  28.5 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.86 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.89 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.88 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  30.06 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  26.99 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.49 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.49 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.49 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>