190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3968 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  100 
 
 
207 aa  423  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  86.47 
 
 
207 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  79.71 
 
 
207 aa  357  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  80.19 
 
 
207 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  81.64 
 
 
207 aa  353  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  73.91 
 
 
207 aa  321  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  65.38 
 
 
208 aa  294  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  64.9 
 
 
208 aa  292  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  48.74 
 
 
223 aa  222  2e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  47.31 
 
 
213 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.93 
 
 
219 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.67 
 
 
200 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  36.84 
 
 
207 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  37.8 
 
 
200 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  33.98 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  39.23 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.98 
 
 
200 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  41.38 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.67 
 
 
202 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.35 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.16 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  38.03 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.86 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.68 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  37.77 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
203 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  41.88 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
203 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
203 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4888  hypothetical protein  38.69 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  33.86 
 
 
203 aa  124  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.5 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.42 
 
 
210 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
207 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  27.48 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.65 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  27.93 
 
 
249 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.31 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  33.88 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  33.88 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.35 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  33.88 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
250 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.09 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  24.89 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.44 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  29.44 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  27.89 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.83 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.34 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  24.44 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.14 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  30.15 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.52 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 
260 aa  71.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>