197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2842 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  73.33 
 
 
210 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  60.87 
 
 
210 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  59.05 
 
 
210 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  55.34 
 
 
207 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  55.34 
 
 
207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  54.37 
 
 
217 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  53 
 
 
207 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  52.22 
 
 
207 aa  227  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  54.82 
 
 
206 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  54.82 
 
 
206 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  54.82 
 
 
206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  54.82 
 
 
206 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  51.91 
 
 
185 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  33.5 
 
 
207 aa  111  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 
206 aa  101  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.14 
 
 
202 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.5 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  32.34 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 
220 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.96 
 
 
204 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  28.91 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.88 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.48 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  29.08 
 
 
200 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.73 
 
 
202 aa  88.6  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  29.84 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 
203 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
202 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.65 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.12 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  30.15 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 
233 aa  82  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.37 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  26.9 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.14 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  28.41 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.82 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.03 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.62 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  28.8 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.29 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.9 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.7 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.78 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.57 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.57 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.57 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.29 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
260 aa  72  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.48 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  28.93 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.09 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.24 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  29.75 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.89 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.61 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.03 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  28.57 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.03 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>