190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1742 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  78.38 
 
 		 208 aa  309  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  64.25 
 
 		 210 aa  278  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  59.2 
 
 		 210 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  61.88 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  61.88 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  61.33 
 
 		 207 aa  241  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  56.37 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  60.22 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  60.22 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  59.67 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  59.67 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  54.15 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  53.11 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  31.87 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  31.67 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.22 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  29.84 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.48 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  27.32 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  28.64 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.16 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  27.32 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.92 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.18 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  28.14 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  28.81 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.5 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.89 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  26.99 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.13 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.98 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.37 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  26.4 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  26.02 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  28.93 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  28.92 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.46 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.59 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  29.89 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  25.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  25.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.62 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.26 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.81 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.87 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.89 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.87 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  27.41 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.87 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.15 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.87 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.37 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>