198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1521 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 		 185 aa  387  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  57.14 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  54.95 
 
 		 207 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  54.4 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  54.4 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  54.4 
 
 		 207 aa  213  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  54.4 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  53.85 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  53.85 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  56.11 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  53.85 
 
 		 217 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  54.44 
 
 		 210 aa  208  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  53.11 
 
 		 210 aa  207  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  52.2 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  33.33 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.39 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.39 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.69 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.65 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  32.28 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.65 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  31.72 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  30 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.35 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.15 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.15 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.15 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.15 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.15 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.65 
 
 		 207 aa  84.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.15 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.09 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.73 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.64 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.64 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.64 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  29.35 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.8 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.91 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.97 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.72 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.42 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.09 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.17 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.48 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.37 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  26.74 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  26 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.92 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.83 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.61 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  25.41 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 		 250 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.12 
 
 		 248 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  25.73 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  24.27 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  28.23 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>