201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4889 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  82.61 
 
 
207 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  83.57 
 
 
207 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  82.61 
 
 
207 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  82.61 
 
 
207 aa  368  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  80.68 
 
 
207 aa  353  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  81.64 
 
 
207 aa  353  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  78.26 
 
 
207 aa  340  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  77.78 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  77.78 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  77.78 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  77.78 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  77.78 
 
 
207 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  77.78 
 
 
207 aa  334  7e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  70.19 
 
 
208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  69.71 
 
 
208 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  53.06 
 
 
223 aa  235  3e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  47.83 
 
 
213 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.88 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  36.95 
 
 
202 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.75 
 
 
200 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  40.21 
 
 
200 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  37.86 
 
 
207 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.51 
 
 
200 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  40.1 
 
 
200 aa  147  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.1 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  41.38 
 
 
203 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.15 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.88 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4888  hypothetical protein  38.32 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  37.93 
 
 
203 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 
205 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.6 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.89 
 
 
199 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  37.89 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  36.46 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  36.09 
 
 
202 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  36.09 
 
 
202 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  36.09 
 
 
202 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  36.09 
 
 
202 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.84 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.96 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
207 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
206 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.58 
 
 
250 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
250 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
250 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 
250 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  29.15 
 
 
249 aa  89  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 
250 aa  89  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
251 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
251 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
251 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  31.19 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.65 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.57 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.9 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.87 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.87 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  28.21 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.47 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  30.49 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.73 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  28.18 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  28.18 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  28.18 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>