206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  97.16 
 
 
211 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  72.6 
 
 
216 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  69.01 
 
 
214 aa  316  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  70.33 
 
 
210 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  70.33 
 
 
210 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  69.52 
 
 
211 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  70.81 
 
 
210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  70.95 
 
 
213 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  68.6 
 
 
214 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  67.15 
 
 
214 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  44.56 
 
 
220 aa  191  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  40.8 
 
 
206 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  43.16 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  46.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  46.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  46.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  46.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  46.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  46.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  46.67 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  45 
 
 
212 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  42.44 
 
 
215 aa  174  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  43.02 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.67 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  43.33 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  43.02 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
210 aa  171  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  46.37 
 
 
212 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  42.22 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  43.26 
 
 
212 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  42.57 
 
 
211 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  41.23 
 
 
221 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  42.22 
 
 
214 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  42.54 
 
 
224 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  38.05 
 
 
213 aa  158  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.59 
 
 
216 aa  158  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  41.21 
 
 
215 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  41.35 
 
 
218 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  41.27 
 
 
218 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  40.62 
 
 
271 aa  154  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  41.11 
 
 
216 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  40.22 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  41.27 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  36.61 
 
 
215 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
218 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  38.05 
 
 
220 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  39.23 
 
 
212 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 
220 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  37.32 
 
 
206 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
223 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  37.62 
 
 
212 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  36.84 
 
 
206 aa  147  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  39.56 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  37.84 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  38.8 
 
 
275 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  38.22 
 
 
260 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
210 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 
214 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  35.41 
 
 
215 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
260 aa  139  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
215 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  34.07 
 
 
293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
215 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
216 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  33.97 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 
208 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  39.52 
 
 
233 aa  121  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  34.41 
 
 
218 aa  121  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  30.15 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  35.2 
 
 
225 aa  118  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  29.65 
 
 
204 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.95 
 
 
213 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 
203 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.94 
 
 
202 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.85 
 
 
202 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 
205 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 
203 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 
203 aa  97.8  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.39 
 
 
204 aa  98.2  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  30.1 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  30.39 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
207 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.59 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>