207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3575 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  61.43 
 
 		 210 aa  288  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.46 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.27 
 
 		 202 aa  140  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  34.95 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  33.5 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.56 
 
 		 200 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  35.96 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  35.89 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.48 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  37.1 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  37.1 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.38 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.08 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.02 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  34.93 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.23 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.98 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.48 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.28 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.33 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.99 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.62 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.62 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.62 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.62 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.62 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.22 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.55 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.88 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.88 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.88 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.98 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.02 
 
 		 250 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  29.95 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 250 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 250 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 217 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  27.73 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  26.63 
 
 		 293 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 251 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  28.38 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.42 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 275 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.83 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  32.53 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.27 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.59 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.02 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>