202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03648 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 		 210 aa  441  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  61.43 
 
 		 207 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.93 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.26 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  44.62 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  39.25 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.47 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  38.35 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.07 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  37.7 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.81 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  37.97 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.16 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  35.38 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  37.44 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.7 
 
 		 200 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  33.33 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  34.3 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.82 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.92 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.92 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.92 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.92 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.92 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.92 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.96 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  34.81 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.63 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.63 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  31.63 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  32.42 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.86 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  30.61 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 250 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 250 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.98 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 250 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.78 
 
 		 250 aa  94.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  25.55 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  25.55 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  27.54 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  25.55 
 
 		 251 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 251 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  28.5 
 
 		 293 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  25.78 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  25.78 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.38 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.58 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  29.13 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  28.95 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  25.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.06 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  25.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.61 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>