121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0426 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0426  protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 		 515 aa  1059    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 335 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 		 664 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 339 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 671 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 671 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  25.41 
 
 		 349 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.52 
 
 		 671 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 354 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 349 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 173 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 221 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 		 276 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 242 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  23.26 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  28.17 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  28.17 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 232 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  27.06 
 
 		 876 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  25.97 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  26.85 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 270 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  23.42 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  24.77 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 251 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 311 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.19 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  30.83 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  25.17 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  25.17 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  26.71 
 
 		 196 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  26.84 
 
 		 224 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  29.45 
 
 		 311 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  27.08 
 
 		 600 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.17 
 
 		 224 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 182 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 182 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  25.87 
 
 		 182 aa  54.3  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 		 179 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 293 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 188 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  28.14 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 296 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  27.07 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 219 aa  51.6  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 220 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 		 235 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  23.65 
 
 		 218 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 236 aa  50.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  27.63 
 
 		 172 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 		 250 aa  50.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  26.35 
 
 		 224 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  26.44 
 
 		 279 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  26.11 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  22.58 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  28.08 
 
 		 652 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  27.4 
 
 		 652 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  27.74 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  26.02 
 
 		 233 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  26.03 
 
 		 226 aa  48.5  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  22.78 
 
 		 234 aa  48.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 		 242 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  26.35 
 
 		 218 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 241 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  27.74 
 
 		 185 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  24.48 
 
 		 179 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3830  hypothetical protein  24.07 
 
 		 535 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220897  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  24.84 
 
 		 276 aa  47.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 209 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  27.74 
 
 		 398 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4754  hypothetical protein  26.67 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.718532  normal  0.082855 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  22.34 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 221 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>