29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4754 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4754  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  430  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.718532  normal  0.082855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 
664 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
354 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 
349 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 
348 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  26.26 
 
 
349 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 
281 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
671 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
671 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 
173 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 
335 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 
339 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  30.18 
 
 
671 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  29.37 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  29.5 
 
 
553 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
265 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2972  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  25.14 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.490443  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  25.18 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  24.74 
 
 
296 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 
307 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  26.11 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
220 aa  42  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 
240 aa  41.6  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  40.68 
 
 
242 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>