21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3830 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3830  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1054    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220897  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 
671 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 
671 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  25.46 
 
 
664 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  25.11 
 
 
671 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  23.05 
 
 
348 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  21.84 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  22.68 
 
 
349 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  22.68 
 
 
349 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  30.93 
 
 
390 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  30.93 
 
 
411 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  30.93 
 
 
390 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25.61 
 
 
219 aa  48.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 
214 aa  47.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 
268 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
231 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
220 aa  45.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  30.63 
 
 
398 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.42 
 
 
270 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 
212 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 
335 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>