39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0226 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
142 aa  280  5.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  51.61 
 
 
164 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  50 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  32.17 
 
 
325 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2666  Vitamin K epoxide reductase  39.47 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1734  Vitamin K epoxide reductase  37.86 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  33.9 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  31.19 
 
 
225 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  35.11 
 
 
390 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  30.33 
 
 
211 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2089  thioredoxin domain-containing protein  24.82 
 
 
304 aa  50.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.576452  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  32.14 
 
 
190 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  30.61 
 
 
210 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  26.98 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  26.98 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  26.98 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  30.84 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  28.12 
 
 
211 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0467  vitamin K epoxide reductase  27.27 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.055508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  26.61 
 
 
215 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  26.17 
 
 
212 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  28.7 
 
 
220 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  29.91 
 
 
214 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  32.28 
 
 
301 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  30.36 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  25.93 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0639  thioredoxin domain-containing protein  32.77 
 
 
327 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  0.153578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  29.63 
 
 
214 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3618  Vitamin K epoxide reductase  28.45 
 
 
339 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00203549  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  26.61 
 
 
258 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  32.67 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  25.68 
 
 
208 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  28.91 
 
 
211 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1688  Vitamin K epoxide reductase  26.56 
 
 
547 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.559526  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  27.19 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  27.1 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3639  Vitamin K epoxide reductase  30.65 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.958294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  29.73 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  24.41 
 
 
198 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>