39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2772 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 		 181 aa  350  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  54.69 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  50.78 
 
 		 214 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  52.15 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  52.15 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  52.13 
 
 		 212 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  52.15 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  55.62 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  46.63 
 
 		 208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  53.19 
 
 		 211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  49.47 
 
 		 211 aa  171  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  53.11 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  49.73 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  52.33 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  45.66 
 
 		 198 aa  151  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  45.6 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  45.55 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  44.44 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  44.97 
 
 		 190 aa  140  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  47.01 
 
 		 223 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  44.63 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  47.89 
 
 		 223 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  48.51 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  47.86 
 
 		 246 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  45.41 
 
 		 241 aa  124  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  46.28 
 
 		 205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  41.18 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  40.62 
 
 		 225 aa  97.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  38.14 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  40 
 
 		 247 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  39.02 
 
 		 258 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  36.84 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  34.19 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  33.06 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  33.06 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  30.95 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  30.83 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  28.57 
 
 		 125 aa  42  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  30.88 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>