35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  42.95 
 
 		 208 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  37.68 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  36.84 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  36.02 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  38.46 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  34.62 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  38.16 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  44.74 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  48.46 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  48.46 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  48.46 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  45.83 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  41.71 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  41.21 
 
 		 220 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  38.29 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  47.97 
 
 		 183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  46.92 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  41.27 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  39.58 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  42.86 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  47.86 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  44.35 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  41.18 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  34.98 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  40.69 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  33.85 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  33.65 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  37.1 
 
 		 190 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  32.97 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  34.4 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  35.38 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  32.84 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  32.09 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  26.17 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>