38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4709 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  49.5 
 
 
214 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  50.48 
 
 
211 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  49.76 
 
 
218 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  49.76 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  49.76 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  51.35 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  49.76 
 
 
211 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  47.34 
 
 
212 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  48.87 
 
 
220 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  52.13 
 
 
210 aa  168  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  50.27 
 
 
210 aa  167  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  49.46 
 
 
183 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  44.15 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  48.77 
 
 
223 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  47.93 
 
 
214 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  45.88 
 
 
223 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  43.23 
 
 
214 aa  154  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  44.57 
 
 
223 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  46.63 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  42.71 
 
 
198 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  42.95 
 
 
246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  39.22 
 
 
241 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  43.59 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  43.92 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  42.86 
 
 
205 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  39.56 
 
 
219 aa  121  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  36.97 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  42.75 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  40.29 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  38.04 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  42.54 
 
 
247 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  34.43 
 
 
229 aa  101  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  34.6 
 
 
216 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  37.01 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  32.22 
 
 
139 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  25.68 
 
 
142 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  28.12 
 
 
125 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>