38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0411 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 		 225 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  54.76 
 
 		 258 aa  222  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  51.61 
 
 		 215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  47.24 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  54.45 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  35.91 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  37.61 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  38.71 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  38.32 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  36.97 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  37.35 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  34.32 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  38.69 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  34.09 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  34.57 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  39.1 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  34.62 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  31.02 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  30.81 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  30.81 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  35.77 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  31.55 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  37.42 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  39.17 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  33.33 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  30.94 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  35.33 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  29.33 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  36.81 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  34.42 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  29.95 
 
 		 190 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  32.89 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  39.39 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  31.75 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  36.07 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  31.19 
 
 		 142 aa  52  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  32.84 
 
 		 139 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  31.43 
 
 		 164 aa  45.1  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>