40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2664 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  94.21 
 
 
190 aa  333  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  52.71 
 
 
214 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  48.42 
 
 
212 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  48.57 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  52.13 
 
 
183 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  53.93 
 
 
214 aa  168  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  48.51 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  50.26 
 
 
218 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  45.3 
 
 
197 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  49.75 
 
 
210 aa  157  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  49.74 
 
 
218 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  49.74 
 
 
218 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  46.53 
 
 
211 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  43.59 
 
 
208 aa  151  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  45.45 
 
 
220 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  46.19 
 
 
214 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  46.6 
 
 
210 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  44.44 
 
 
181 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  39.77 
 
 
223 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  42.17 
 
 
223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  40.11 
 
 
198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  39.74 
 
 
223 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  43.88 
 
 
241 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  33.66 
 
 
219 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  44.26 
 
 
205 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  33.55 
 
 
225 aa  94.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  35.77 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  34.12 
 
 
258 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  33.78 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  40.35 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  32.76 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  33.53 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  31.88 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  30 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  30.77 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  30.16 
 
 
142 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  23.08 
 
 
301 aa  45.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  29.17 
 
 
139 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5247  peptidase C39 bacteriocin processing  25.23 
 
 
542 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>