41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4978 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  100 
 
 
214 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  60.09 
 
 
211 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  60.28 
 
 
214 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  52.34 
 
 
212 aa  217  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  59.24 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  50 
 
 
208 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  54.21 
 
 
183 aa  201  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  51.92 
 
 
211 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  52.58 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  54.01 
 
 
218 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  53.48 
 
 
218 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  53.48 
 
 
218 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  54.97 
 
 
214 aa  187  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  52.27 
 
 
220 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  52.69 
 
 
197 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  52.71 
 
 
201 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  54.97 
 
 
190 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  51.22 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  47.39 
 
 
210 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  52.41 
 
 
223 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  49.4 
 
 
223 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  50.78 
 
 
181 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  46.05 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  45.98 
 
 
241 aa  138  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  40.11 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  46.9 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  44.74 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  40.27 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  38.69 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  33.33 
 
 
247 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  33.9 
 
 
215 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  33.71 
 
 
229 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  35.29 
 
 
220 aa  92  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  30.34 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  32.21 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  29.36 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  30.37 
 
 
164 aa  45.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  29.63 
 
 
142 aa  45.4  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  27.49 
 
 
325 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  23.74 
 
 
301 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  27.08 
 
 
125 aa  41.6  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>