41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2218 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
198 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  49.21 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  49.21 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  49.21 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  47.28 
 
 
211 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  47.37 
 
 
211 aa  147  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  42.39 
 
 
211 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  42.71 
 
 
208 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  43.59 
 
 
210 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  40.66 
 
 
212 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  44.07 
 
 
183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  45.73 
 
 
181 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  39.56 
 
 
214 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  42.94 
 
 
220 aa  134  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  39.89 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  41.42 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  42.86 
 
 
210 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  42.19 
 
 
223 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  38.19 
 
 
223 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  37.74 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  39.53 
 
 
223 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  41.73 
 
 
246 aa  111  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  39.56 
 
 
201 aa  111  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  39.56 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  37.72 
 
 
214 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  34.39 
 
 
219 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  34.23 
 
 
205 aa  101  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  39.17 
 
 
225 aa  97.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  39.17 
 
 
258 aa  87.8  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  36.64 
 
 
247 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  34.17 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  32.94 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  32.37 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  27.75 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  26.98 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  30.56 
 
 
139 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  34.82 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0639  thioredoxin domain-containing protein  27.34 
 
 
327 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  0.153578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  25.37 
 
 
301 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  28.57 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  24.41 
 
 
142 aa  41.2  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>