38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1207 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  48.87 
 
 
208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  50.77 
 
 
214 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  50.23 
 
 
218 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  50.79 
 
 
212 aa  188  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  49.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  49.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  50.81 
 
 
211 aa  185  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  47.95 
 
 
211 aa  184  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  56.8 
 
 
210 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  47.95 
 
 
211 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  44.04 
 
 
223 aa  165  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  41.9 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  48.69 
 
 
210 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  49.42 
 
 
214 aa  160  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  48.96 
 
 
183 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  46.52 
 
 
197 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  42.25 
 
 
223 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  53.14 
 
 
181 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  47.93 
 
 
214 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  42.93 
 
 
198 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  45.45 
 
 
201 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  45.6 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  43.88 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  41.29 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  41.78 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  35.64 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  36.16 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  38.36 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  38.33 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  34.92 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  35 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  34.42 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  32.7 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  35.43 
 
 
245 aa  85.1  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  29.1 
 
 
139 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  29.59 
 
 
125 aa  45.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  27.19 
 
 
142 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>