35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0441 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  100 
 
 		 216 aa  438  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  65.5 
 
 		 245 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  41.79 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  37.56 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  35.91 
 
 		 225 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  37.25 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  43.33 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  34.6 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  35.43 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  31.88 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  27.27 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  30.34 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  31.71 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  32.68 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  30.05 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  31.55 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  30.05 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  30.05 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  31.33 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  32.29 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  30.99 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  36.67 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  32.84 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  36 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  34.88 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  32.12 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  34.06 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  31.85 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  33.61 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  29.44 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  26.98 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  35.14 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  29.63 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  25.67 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  32.32 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>